Terungkap! Ada Gen Misterius di Balik Virus Corona

Redaksi - Serba-serbi

Jumat, 13 November 2020 - 15:00 WIB

Ikuti Kami di:

WahanaNews.co | Pemahaman yang lebih baik soal Covid-19 memungkinkan kita mengontrol pandemi COVID-19 lebih intens.

Baca Juga:

13 Gorila di Bonbin Atlanta Terdeteksi Positif Covid

Baru-baru ini, sekelompok tim peneliti internasional menemukan pemahaman baru dari virus penyebab COVID-19 itu. Dalam sebuah riset yang dipublikasi jurnal eLife pada Rabu (11/11), mereka menemukan gen misterius yang selama ini tak pernah disadari berada di virus corona.

Gen yang baru ditemukan ini disebut ORF3d. Peneliti menjelaskan, gen tersebut bisa jadi tak disadari keberadaannya selama ini karena ia adalah contoh dari apa yang disebut gen yang tumpang tindih (overlapping genes/OLGs).

Sebagai gambaran, peneliti menyebut kalau ORF3d sejenis 'gen di dalam gen'. Gen tumpang tindih sendiri terjadi ketika satu bentangan nukleotida mengkodekan dua protein berbeda dalam kerangka pembacaan yang berbeda.

Baca Juga:

PPKM di Bali Turun ke Level 3

"Dalam hal ukuran genom, SARS-CoV-2 dan kerabatnya termasuk di antara virus RNA terpanjang yang ada," jelas Chase Nelson, penulis utama riset sekaligus ahli bioinformatika dari Museum Sejarah Alam AS, dalam pernyataan resminya. "Dengan demikian mereka mungkin lebih rentan terhadap 'tipu muslihat genom' daripada virus RNA lainnya."

Limitasi metode ilmiah

Dalam laporannya, para peneliti menjelaskan kalau virus memang cukup rentan memiliki gen yang tumpang tindih. Jadi, ORF3d bukan penemuan yang mengejutkan.

Keberadaan 'gen di dalam gen' sering luput dari pengurutan genetika (genetic sequences) yang dilakukan ilmuwan. Alat pemindai rangkaian gen umumnya diprogram untuk mendeteksi gen individu. Alat tersebut tidak harus melihat rangkaian gen secara menyeluruh di antara nukleotida gen yang berdekatan secara berurutan. Artinya, alat yang dipakai ilmuwan memang tidak dirancang untuk menemukan gen tumpang tindih.

Masalahnya, dalam konteks virus corona SARS-CoV-2, keberadaan gen yang tumpang tindih bisa menjadi titik buta yang serius. Para ilmuwan sebenarnya terus berupaya memahami virus corona, namun banyak hal yang tetap mereka belum tahu.

"Gen tumpang tindih yang hilang menempatkan kita dalam risiko mengabaikan aspek penting biologi virus," kata Nelson.

Adapun dalam penemuan gen ORF3d, para peneliti mengembangkan program komputer yang menyaring genom untuk pola perubahan genetik yang unik untuk gen yang tumpang tindih. Dari program tersebutlah mereka menemukan ORF3d.

Satu Penemuan Kecil Gen Misterius, Tapi Signifikan

Setelah menemukan gen yang tertindih ini, para peneliti menyelidiki database genom dan menemukan kalau ORF3d tersebut telah diidentifikasi sebelumnya dalam satu varian virus corona yang memengaruhi trenggiling di Guangxi, China.

ORF3d sendiri sebelumnya telah salah diklasifikasikan sebagai gen ORF3b pada virus corona lain, termasuk SARS-CoV. Namun, peneliti menegaskan kalau kedua gen itu sebenarnya bukan hal yang sama.

"Kedua gen itu tidak terkait dan menyandikan protein yang sama sekali berbeda," kata Nelson. "Artinya, pengetahuan tentang SARS-CoV ORF3b tidak boleh diterapkan pada SARS-CoV-2 ORF3d."

Hingga saat ini, para peneliti belum mengetahui apa peran gen ORF3d di virus corona. Satu-satunya pengetahuan kita soal gen tersebut, kata peneliti, hanya didasari penelitian darah sebelumnya dengan objek kajian pasien COVID-19 manusia. Riset itu menunjukkan, ORF3d memperoleh respons antibodi yang kuat.

"Kami belum mengetahui fungsinya atau apakah ada signifikansi klinis," kata Nelson.

"Tapi kami memperkirakan gen ini relatif tidak mungkin dideteksi oleh respons sel-T, berbeda dengan respons antibodi. Dan mungkin itu ada hubungannya dengan bagaimana gen itu bisa muncul," sambungnya.

Tim penelitian Nelson berharap, peneliti lain di masa depan akan menyelidiki gen yang mereka temukan di laboratorium untuk menentukan fungsinya dan mungkin menentukan peran apa yang mungkin dimainkannya dalam kemunculan virus pandemi.

Meski saat ini fungsi gen ORF3d masih misterius, penelitian yang dilakukan Nelson membawa kita semakin baik memahami virus corona.

Sejauh ini, virus corona diketahui cuma memiliki sekitar 15 gen. Dengan kondisi pandemi COVID-19 yang semakin memburuk, satu penemuan gen baru, apalagi gen yang tumpang tindih, merupakan perkembangan yang signifikan. [qnt]

Tag:

Corona